کمبود تختهای بیمارستانی در کشور، فرسودگی بیمارستانها و حالا بار هزینههای درمان مهاجران غیرقانونی تبدیل به چالشی برای نظام بهداشت و درمان ایران شده است. آن هم در شرایطی که بررسیها نشان میدهد بسیاری از اتباع غیرمجاز در ایران بدون پرداخت هزینه از بیمارستانها مرخص میشوند. چند سالی است که اتباع مجاز در ایران تحت پوشش بیمه سلامتاند و بیش از ۹۵ درصد این اتباع تحت پوشش بیمه مهاجران افغانی هستند. حق بیمه این مهاجران را دولت پرداخت میکند و هزینههای درمانی آنها را نیز بیمهها پرداخت میکند. آماری از میزان هزینه پرداختی نظام سلامت برای بهداشت و درمان اتباع قانونی و غیرقانونی در دسترس نیست. با این حال باتوجه به آمار غیررسمی از جمعیت حدود ۱۰ میلیون آنها در ایران یارانههای بهداشت و درمان آنها سرسامآور خواهد بود. چراکه اتباع قانونی از یارانه سلامت استفاده میکنند و آنهایی که نیز به صورت غیر قانونی وارد کشور ایران شدهاند نیز در اغلب مواقع هزینههای درمان را پرداخت نمیکنند و از مددکاری اجتماعی بیمارستانها استفاده میکنند. منابع حوزه سلامت به خصوص حوزه مددکاری محدود است و این بیم وجود دارد که در چنین شرایطی اتباع از امکانات بیشتری نسبت به ایرانیان در حوزه سلامت استفاده کنند و حق تامین سلامت مردم کشور پایمال شود.