تعدادی ایراد گرفتند که ابزار فلسفه منطق است و ابزار دین ایمان، پس ترکیب فلسفه با دین تناقض است. گاه از فلاسفه در برابر اسلام دفاع کردند و از تکفیر بزرگانی مانند ابنسینا توسط غزالی یا تبعید ملاصدرا نالیدند و گله کردند که اسالمی که فالسفه را تاب نیاورد چه نیاز به فلسفه اسالمی دارد!